Le 20 décembre 2019, à la suite de la publication d’un arrêté, l’Agence du numérique en santé se substituait à l’Agence des systèmes d'information partagés de santé (ASIP-santé). En lien direct avec le ministère de la Santé via la Délégation au numérique en santé (DNS) – l’un de ses membres fondateurs au même titre que l’Assurance maladie et la Caisse nationale de solidarité pour l’autonomie (CNSA) – elle participe à la mise en œuvre de la feuille de route du numérique en santé.

La mission de cette agence gouvernementale présidée par la pharmacienne Isabelle Adenot : créer les conditions du développement et de la régulation du numérique en santé, promouvoir l’innovation au profit des professionnels et des usagers et assister les pouvoirs publics dans la conduite de projets numériques d’intérêt national. Parmi ses actions : mettre en place des référentiels régaliens et services socles nécessaires au développement de la e-santé. Elle a également vocation à accompagner les territoires dans leur transformation numérique.